Nuestra institución ofrece dos programas doctorales, uno propio y otro en cooperación con el Seminario Teológico de Dallas. Ambos doctorados buscan llevar a la persona a una mayor conciencia ministerial y teológica en el ministerio que realizan. El Ph.D. en Educación Teológica desarrolla la reflexión profunda del quehacer educativo y brinda poderosas herramientas que permiten a la persona graduada desarrollarse más eficientemente en instituciones de educación teológica en América Latina y más allá. El D.Min. brinda competencias y herramientas que le permiten a las persona egresada desarrollarse con eficiencia en los más variados campos del ministerio cristiano hoy.